De Protestante Gemeente Leidschendam bestaat uit 3 wijken met elk een eigen wijkkerkenraad. In de Algemene Kerkenraad zijn de drie wijkkerkenraden vertegenwoordigd.
De drie wijkkerkenraden binnen de Protestante Gemeente Leidschendam zijn:
Wijkkerkenraad Heuvelwijk
Wijkkerkenraad Leidschenveen
Wijkkerkenraad Vlietwijk
